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吉林大學理論物理學科是由我國著名理論物理學家、中科院院士吳式樞教授親手創建的。理論物理學科是國家首批批準的博士點與碩士點，是直屬院校省重點學科。一九九一年將原理論物理教研室一分為二,分為理論物理中心(主要從事基礎理論研究)和理論物理教研室(主要從事基礎理論應用研究)，學校任命吳式樞院士為第一任理論物理中心主任. 二00一年從理論物理教研室中分出聲學系,該教研室的其余部分與原理論物理中心合并,成為現在的理論物理中心.

理論物理中心是一個開放的研究中心。國內外許多著名學者曾到我中心進行工作訪問和學術交流。其中有些被聘為吉林大學的兼職和名譽教授。如德國Tuebingen大學理論物理研究所所長A. Faessler教授，德國Johann Wolfgang Goethe大學理論物理研究所所長W. Greiner教授（曾獲諾貝爾獎提名）及美國紐約州立大學石溪分校的終身教授郭子斯先生都是我校的名譽教授。

理論物理中心現有人員包括：教授10人，副教授10人，講師1人，工程師2人。

目前的研究方向包括：天體物理與宇宙學、粒子物理和核物理、理論凝聚態物理、物理交叉學科。